這兩種Th細胞會互相影響，Th1能調節Th2的活性；相對地，Th2會抑制Th1的活性。如果Th1活性高的話就會引起自體免疫反應，若體內的Th2的活性過高，就會引發過敏問題。Th2與氣喘、過敏及自體免疫心肌炎有關，屬於體液免疫反應。

說明：

• Th1細胞：會分泌第一類細胞激素，例如IL-2和干擾素γ(IFN-γ)，IL-12，活化吞噬細胞並啟動其吞噬能力。
• Th2細胞：會分泌IL-5 (吸引白血球聚集、引起發炎反應)、IL-4 (刺激B細胞製造IgE抗體^註1)與IL-13 (會刺激呼吸道上皮細胞，造成平滑肌收縮等生理反應，進而引起呼吸道過度反應)。

註1：這些IgE抗體會附著在肥大細胞上，伺機捕捉過敏原。一旦過敏原和IgE結合，肥大細胞就會被活化，進而釋放組織胺等發炎介質，引起呼吸道緊縮或局部紅腫、發癢。氣喘正是呼吸道長期慢性發炎而引發呼吸道狹窄的疾病。